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        1. 當前位置 首頁 科研隊伍

          中科院青促會會員

          陳萍(客座)  博士 研究員  

          中國科學院青年創新促進會會員
          中科院“卓越青年科學家”項目獲得者

          研究方向:染色質結構建立及其表觀遺傳調控分子機理

          電子郵件:chenping@ibp.ac.cn

          電       話:010-64856269

          通訊地址:北京市朝陽區大屯路15號(100101)

          英文版個人網頁:http://english.ibp.cas.cn/faculty/index_18316.html?json=http://www.salesdujour.com/sourcedb_ibp_cas/cn/ibpexport/EN_zkyqchhy/202005/t20200519_5582920.json

           

          簡       歷:

            1998.09 - 2002.06  武漢大學化學與分子科學學院,理學學士

            2002.09 - 2005.06  武漢大學化學與分子科學學院,分析化學碩士

            2005.10 - 2009.06  英國諾丁漢大學,生物分子化學博士

            2009.09 - 2011.12  中國科學院生物物理研究所,助理研究員

            2011.12 - 2014.08  中國科學院生物物理研究所,副研究員

            2014.09 - 2019       中國科學院生物物理研究所,研究員

          獲獎及榮譽:

           

          社會任職:

           

          研究方向:

            真核細胞中基因組DNA與組蛋白組裝形成染色質;任何有關DNA的生命活動都是在染色質這個結構平臺上進行的。細胞通過調控細胞核內染色質結構的動態變化來有選擇性地進行基因的激活和沉默,從而控制細胞自我維持或定向分化。但是,人們對于染色質高級結構的建立及其調控機理的研究還十分有限。我們利用成功建立的具有國際領先水平的染色質體外組裝和結構分析平臺,簡化體系,分解各種不同的調控因素來研究它們各自對染色質結構及功能調控的分子機制。目前已經成功獲得高質量30nm染色質纖維,并和朱平課題組合作利用冷凍電鏡技術解析了高分辨率(11?)的30nm染色質纖維的三維結構,國際上首次發現常規30nm染色質纖維是以四個核小體為結構單元,在H1-H1相互作用下相互扭曲形成一個左手雙螺旋結構;并首次明確連接組蛋白H1在30nm染色質纖維形成過程中的重要作用(Science2014,research article)。同時,我們系統地研究了兩個重要組蛋白變體H2A.Z和H3.3對染色質高級結構動態變化及基因轉錄調控的作用機理,從分子機理上揭示它們對干細胞分化過程中染色質高級結構及基因轉錄的動態調控過程(Genes Dev. 2013;Nucleus 2014)。鑒于染色質結構的高度動態性和異質性,我們將進一步建立和優化生物物理技術,包括單分子技術等,深入探討該染色質結構建立的分子基礎,重點研究四個核小體結構單元內部及結構單元之間核小體-核小體相互作用建立的分子基礎及其可能的調控機制;利用冷凍電鏡技術進一步解析含有不同表觀遺傳調控因素,包括組蛋白修飾(H2A泛素化、組蛋白乙?;龋┖徒M蛋白變體(H2A.Z等)的30nm染色質纖維的精細結構,研究體內一些重要異染色質區域形成的結構基礎,并探討這些具有重要生物學功能的表觀遺傳因素對染色質結構調控的分子機制;同時結合前期工作已經建立的細胞內染色質結構和功能研究,從分子基礎上探討這些重要表觀遺傳因素行使其相關生物學功能的結構機理。

          承擔項目情況:

           

          代表論著:

          1. Ping Chen*, L. Dong*, M. Hu, Y.Z. Wang, X. Xiao, Z. Zhao, J. Yan, P.Y. Wang, D. Reinberg, M. Li#, W. Li# and G.H. Li#. Functions of FACT in Breaking Nucleosome and Maintaining Its Integrity at Single-nucleosome Level. Mol. Cell (2018) 71, 284-293

          2. X. Xiao*, L. Dong*, Y. Wang*, P. Wang, M. Li, G. Li, Ping Chen# and W. Li#. Dissection of Structural Dynamics of Chromatin Fibers by Single-molecule Magnetic Tweezers. Biophys Rep (2018) 4, 222-232

          3. Ping Chen, G.H. Li. Structure and Epigenetic Regulation of Chromatin Fibers. Cold Spring HarbSymp Quant Biol (2017) doi: 10.1101/sqb.2017.82.033795.

          4. W. Li*, Ping Chen*, J. Yu, L. Dong, D. Liang, J.X. Feng, J. Yan, P.Y. Wang, Q. Li, Z. Zhang, M. Li and G.H. Li. FACT remodels the tetranucleosomal unit of chromatin fibers for gene transcription. Mol. Cell (2016)64, 120-133 (* co-first author)

          5. Q. Fang*, Ping Chen*, M. Wang, J. Fang, N. Yang, G.H. Li and R.M. Xu. Human cytomegalovirus IE1 alters the higher-order chromatin structure by targeting the acidic patch of the nucleosome. eLife (2016),5:e11911

          6. F. Song*, Ping Chen*, D.P. Sun, M.Z. Wang, L.P. Dong, D. Liang, R.M. Xu, P. Zhu and G.H. Li. Cryo-EM study reveals a left-handed double helical structure of 30 nm chromatin fiber twisted by tetra-nucleosomal units. Science, (2014) 344, 376-380

          7. Ping Chen, P. Zhu and G.H. Li. New insights into the helical structure of 30-nm chromatin fibers. Protein. Cell. (2014) 5, 489-491

          8. Ping Chen*, Y. Wang* and G.H. Li. Dynamics of histone variant H3.3 and its coregulation with H2A.Z at enhancers and promoters. Nucleus(2014) 5, 1-7.

          9. Ping Chen*, J.C Zhao*, Y. Wang*, H.Z Long, D. Liang, L. Huang, Z.Q. Wen, W. Li, X. Li, H.L. Feng, H.Y. Zhao, P. Zhu, M. Li, Q.F. Wang and G.H. Li. H3.3 actively marks enhancers and primes gene transcription via opening higher-ordered chromatin. Genes Dev. (2013) 27, 2109-2124

          10. Ping Chen*, J.C. Zhao*, and G.H. Li. Histone variants in development and diseases. J Genet. Genomics. (2013) 40, 355-365

          11. D.P Sun, F. Song, L. Huang, K. Zhang, G. Ji, Ping Chen# and P. Zhu#. In vitro assembly and electron microscopic analysis of 30 nm chromatin fibers. Prog. Biochem. Biophys.(2013) 40, 739-747 (# co-corresponding author)

          12. G. Yuan, B. Ma, W. Yuan, Z. Zhang, Ping Chen, X. Ding, L. Feng, X. Shen,S. Chen, G.H. Li, and B. Zhu. Histone H2A ubiquitination inhibits the enzymatic activity of H3 lysine 36 methyltransferases. J. Biol. Chem. (2013) 288, 30832-30842.

          13. C.P. Liu, C.Y. Xiong, M.Z. Wang, Z.L. Yu, N. Yang, Ping Chen, Z.G. Zhang, G.H. Li, R.M. Xu. Structure of the variant histone H3.3–H4 heterodimer in complex with its chaperone DAXX. Nat. Struct. Mol. Biol. (2012) 19,1287-1292

          14. C. Wang,J.Shen, Z.Yang, Ping Chen, B.Zhao, W.Hu, W.Lan, X.Tong, H.Wu, G.H.Li, C.Cao. Structural basis for site-specific reading of unmodified R2 of histone H3 tail by UHRF1 PHD finger. Cell Research(2011) 21,1379-1382

          15. Ping Chen, C.L. Evans, J.D. Hirst and M.S. Searle.Structural insights into the two sequential folding transition states of the PB1 domain of NBR1 from Φ value analysis and biased molecular dynamics simulations. Biochemistry.(2011) 50, 125-135

          16. Ping Chen and G.H. Li. Dynamics of the higher-order structure of chromatin. Protein. Cell. (2010) 1, 967-971

          17. Ping Chen, J. Long and M.S. Searle. Sequential barriers and an obligatory metastable intermediate define the apparent two-state folding pathway of the ubiquitin-like PB1 domain of NBR1. J. Mol. Biol.(2008) 376, 1463-1477.

          18. Ping Chen, H.H. Liu, C. Ran, Z.L. Zhang, D.W. Pang, Z.X. Xie, H.Z. Zheng, Z.X. Lu. Visualized investigation of yeast transformation induced with Li+ and polyethylene glycol. Talanta(2008) 77, 262-268

           

          (資料來源:陳萍研究員,2019-03-25)

           

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